台南火車站的後站位於台南市東區前鋒路,與前站相對,是為了分散人流並方便西區居民及旅客通行而設。後站建築風格相對較為簡約,與前站的歷史建築相比,後站更注重實用性和便捷性。外觀設計以簡約為主,使用玻璃和金屬材質,展現出透明和輕盈的視覺效果,營造出明亮開放的空間感。建築採用大面積的落地玻璃窗,使自然光充足地進入站內,為旅客帶來舒適的等候空間。後站的設計特別考量無障礙設施,包括輪椅友善的出入口、自動扶梯和電梯,方便各類旅客使用。外部空間寬敞,有人行道和自行車停放區,方便通勤族和騎自行車的旅客。後站的設計強調功能性,並和周圍的交通設施相連,讓旅客能輕鬆轉乘公車或計程車,連接到台南市的各個地區。後站的設立不僅改善了台南車站周邊的交通流量,還提升了周邊地區的生活便利性。與前站的歷史建築風格相比,後站顯得較新穎,符合現代建築設計的實用性需求。此站口主要服務居住於西側的民眾,以及台南科學園區的通勤旅客,也為前往成大醫院的民眾提供了便捷的通道。