位於臺南市中西區,是中華民國直轄市定古蹟,也是昔日臺灣府城七寺八廟之一。建成年代最早的說法為依陳文達《臺灣縣志》為大清康熙二十二年(1683年)之後由鄉人同建;或者依大正十六年重修水仙宮碑記載建於清康熙癸未四十二年(1703年);最普遍的說法是蔣允焄所撰碑記所載該廟建於康熙五十四年(1715年),同時王必昌《重修臺灣縣志》與謝金鑾《續修臺灣縣志》皆作建於康熙五十四年。 廟內主祀水仙尊王,即「一帝兩王二大夫」的大夏聖帝—大禹、白盟尊王—寒奡、西楚尊王—項羽、忠烈尊王—屈原和伍盟尊王—伍子胥。過去尚有後殿,奉祀觀音佛祖、釋迦牟尼佛、三官大帝、韋馱菩薩、司命灶君和福德正神,二戰時後殿拆毀後部分神像不知所終。該廟所在之地過去是臺灣府城西定坊五條港之一的南勢港,是三郊的總部所在地,曾於宮北側設三益堂處理三郊事務,該廟亦由當地商人合資興建。